״מיומנויות חקר בקופסה״ היא פעילות בה התלמידים יכולים להתאמן על מיומנויות מחקר מחוץ למעבדה, בעזרת הדמיון. עבור ניסוי נתון, התלמידים מתבקשים לפתור ״תעלומות חקר״ שהם במקבלים בקופסה. כל קופסה עוסקת במיומנות חקר אחרת. ארבע הקופסאות בפעילות זו קשורות לניסוי ״פחם פעיל״.

נושא מתכנית הלימודים: מיומנויות חקר